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海量DNA測序數據無損快速壓縮平臺

1078   編輯：管理員   來源：中冶有色網  
2023-03-19 08:58:00
本發明公開了一種海量DNA測序數據無損快速壓縮平臺，涉及DNA測序數據壓縮平臺領域，該平臺將輸入FASTQ數據分割成元數據、堿基和質量分數三個數據流，并根據它們自身特點分別獨立地壓縮：去除元數據流中的重復片段并使用LZMA算法進行壓縮；對質量分數流使用游程編碼和算術編碼壓縮；使用匹配工具BWA將短讀與參考基因組比對，提取比對結果中的堿基流表達信息并使用LZMA算法、游程編碼、算術編碼進行壓縮。該平臺針對DNA序列本身具有的冗余性進行壓縮，減少了壓縮所需的存儲空間。
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聲明：
“海量DNA測序數據無損快速壓縮平臺” 該技術專利(論文)所有權利歸屬于技術(論文)所有人。僅供學習研究，如用于商業用途，請聯系該技術所有人。
我是此專利(論文)的發明人(作者)
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