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針對FASTQ數據的多線程快速存儲無損壓縮方法及其系統

866   編輯：管理員   來源：中冶有色網  
2023-03-19 08:58:02
本發明提供一種針對FASTQ數據的多線程快速存儲無損壓縮方法，應用于DNA序列的壓縮，其中，所述方法包括：數據分類步驟：輸入原始FASTQ數據，并將所述原始FASTQ數據的短讀分成元數據、質量分數和堿基序列三個數據流；數據壓縮步驟：針對元數據，利用增量編碼方式進行檢測并消除元數據的冗余信息；針對質量分數，利用比特級別的PPM預測模型和算術編碼進行壓縮；針對堿基序列，利用固定階位的改良型算術編碼進行壓縮；數據輸出步驟：將不同數據流的壓縮結果進行歸檔合并，輸出經過壓縮后的最終數據。本發明還提供一種針對FASTQ數據的多線程快速存儲無損壓縮系統。本發明提供的技術方案能提高壓縮效率和壓縮速度。
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“針對FASTQ數據的多線程快速存儲無損壓縮方法及其系統” 該技術專利(論文)所有權利歸屬于技術(論文)所有人。僅供學習研究，如用于商業用途，請聯系該技術所有人。
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