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基于靶標的基因簇定向挖掘方法

1152   編輯：管理員   來源：中冶有色網  
2023-03-19 07:29:45
本發明公開了一種基于靶標的基因簇定向挖掘方法，該方法可以挖掘出與所提供的靶標蛋白質相關的、可能具有次級代謝產物的生物合成基因簇，這些基因簇后續可以通過生物化學實驗，驗證是否具有產生與靶標蛋白質存在相互作用的活性天然產物的功能。步驟如下：1)構建蛋白質和基因組數據庫；2)將靶標蛋白質序列與蛋白質數據庫中的蛋白質序列進行序列比對，獲得數據庫中相似的蛋白質；3)提取相似蛋白質對應的基因組，以及各個基因組中相似蛋白質編碼基因的位置；4)檢測每個基因組中所含的基因簇位置；5)判斷檢測出的每個基因簇是否命中，即判斷相似蛋白質編碼基因是否處于基因簇中；6)進行基因備份分析，取得分較高的基因簇作為挖掘結果。
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聲明：
“基于靶標的基因簇定向挖掘方法” 該技術專利(論文)所有權利歸屬于技術(論文)所有人。僅供學習研究，如用于商業用途，請聯系該技術所有人。
我是此專利(論文)的發明人(作者)
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