本發明公開了一種基于異構網絡嵌入的藥物靶標相互作用預測方法,該方法基于化學結構相似的藥物往往能與相似的靶標相互作用的假設,將藥物?藥物相似性網絡、靶標?靶標相似性網絡以及藥物?靶標相互作用網絡合并到藥物?靶標異構網絡中;使用基于起始節點的游走序列,構建神經網絡分類模型并將游走序列作為其輸入,對分類模型進行訓練并學習得到所有節點的向量表示;對于藥物?靶標相互作用的預測,給定一對藥物?靶標對,從學習得到的節點向量中提取對應的藥物和靶標的向量表示,并對兩個向量進行Hadamard積運算,將得到的結果作為隨機森林分類器的輸入,得到最終的預測結果。根據實驗驗證可知,本方法預測效果和適用性較好。
聲明:
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