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基于投影鄰域非負矩陣分解的lncRNA蛋白質關聯預測方法

700   編輯：管理員   來源：中冶有色網  
2023-03-19 07:28:47
本發明公開了一種基于投影鄰域非負矩陣分解的lncRNA蛋白質關聯預測方法，首先，根據lncRNA序列、lncRNA表達譜數據、蛋白質序列、蛋白質的GO功能注釋數據以及lncRNA和蛋白質的交互網絡，計算得到多種lncRNA特征、蛋白質特征、lncRNA相似矩陣和蛋白質相似矩陣。其次，將多種lncRNA相似網絡進行融合得到整合的lncRNA相似網絡，將多種蛋白質相似網絡進行融合得到整合的蛋白質相似網絡。最后，結合整合的lncRNA(蛋白質)相似網絡和多種lncRNA(蛋白質)特征，提出了一種特征投影的鄰域非負矩陣分解算法來預測lncRNA蛋白質的潛在交互。本發明不僅能準確的預測新的lncRNA蛋白質交互，同時還可以預測沒有關聯任何lncRNA(蛋白質)的新的蛋白質(lncRNA)，有效的避免了生物化學實驗導致的高人力物力消耗。
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聲明：
“基于投影鄰域非負矩陣分解的lncRNA蛋白質關聯預測方法” 該技術專利(論文)所有權利歸屬于技術(論文)所有人。僅供學習研究，如用于商業用途，請聯系該技術所有人。
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