毛細管電泳和質(zhì)譜聯(lián)用的直接RNA測序技術(shù)

本發(fā)明涉及一種直接對RNA的序列及其化學(xué)修飾同時(shí)進(jìn)行測定的技術(shù)。和DNA相比，對RNA上化學(xué)修飾的研究相對滯后，其主要原因在于沒(méi)有一種方便精準的方法檢測這些化學(xué)修飾。本發(fā)明針對現行間接RNA測序技術(shù)的種種問(wèn)題，直接對RNA進(jìn)行序列測定。先將RNA降解成長(cháng)短不一的梯坎RNA片段，再用毛細管電泳和質(zhì)譜聯(lián)用分析檢測這些降解的RNAs。每一個(gè)降解的梯坎RNA片段都對應著(zhù)不同的遷移時(shí)間和不同的質(zhì)譜值。把這些長(cháng)短不一的梯坎RNA片段從小到大排序，再用這些梯坎RNA片段之間質(zhì)譜差值來(lái)計算原RNA從5`和3`的堿基序列。本技術(shù)不僅可以直接對常規的RNA測序，而且可以同時(shí)測定這些RNA上的化學(xué)修飾。