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基于像素圖表征和CNN的可解釋性分子動力學軌跡分析方法

964   編輯:管理員   來源:中冶有色網  
2023-03-19 08:59:24
本發明公開了基于像素圖表征和CNN的可解釋性分子動力學軌跡分析方法,獲取兩條不同類別的MD軌跡數據集,將原子和殘基對應,并刪除H原子;進行數據預處理并用像素圖方式表征數據,得到兩組帶有標簽的像素圖數據集,并對CNN模型進行訓練和測試;構造解釋器輸出像素評分矩陣;采樣并獲取像素評分矩陣,累加并求平均值,得到原子評分;對一個殘基中所有原子的評分求平均值,得到該殘基評分。本發明采用像素圖表征方式直接將所有的坐標信息映射到圖像中,能達到盡可能小的信息損失。將所有的坐標信息映射到圖像中,在表征過程中達到線性無損,同時避免了計算大量描述符的時間和人力成本。
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