本發明公開了一種基于小波變換支持向量機對蛋白質功能與結構的在線預報方法,該方法包括如下步驟:1.建立蛋白質序列數據集的訓練樣本集;2.利用氨基酸的物理化學性質將蛋白質氨基酸序列轉化為數值序列;3.利用小波變換進行特征提??;4.支持向量機訓練生成的蛋白質特征數據集;5.需要預報的蛋白質序列的讀入、數據轉換及蛋白質結構與功能的在線預測。該方法能實現對未知蛋白質的家族及功能的預測,驗證結果表明對G蛋白偶聯受體、酶蛋白、蛋白質亞細胞結構、蛋白質二級結構均有好的預測準確率。在線預測時,用戶只需在預報網頁界面提供要預報的蛋白質序列,對其數據進行轉換后利用小波變換對其進行特征提取,完成支持向量機的訓練和目標的預報,輸出預報結果。
聲明:
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