本發明提供一種新的融合核苷酸二聯體結構信息和物理化學特性的RNA序列表示方法,將核苷酸二聯體結構信息和其它物理化學特性構建RNA序列物理化學矩陣PCM,此矩陣含有RNA序列結構信息和序列順序信息。通過對矩陣中的每行數據建立灰色模型并計算其自相關因子和行與行之間的互相關因子得到序列局部信息,將PCM轉換成二維圖像,計算其圖像幾何距得到序列全局信息。將所得到的描述序列局部信息和全局信息的因子相結合,得到RNA序列離散向量描述模型。本方法用于RNA屬性類型預測及RNA修飾位點的位預測中,能明顯提高相關預測器的預測成功率,具有廣闊的運用前景。
聲明:
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