本發明涉及一種基于分子親電矢量(MEV)和擴展支持向量機(SVM)的基因毒性概率預測方法,適用于根據有機化合物分子結構信息對該化合物進行虛擬毒性評價和篩選。首先,對輸入分子結構使用基于文本的化學結構提問語言SMARTS和可編程原子分類PATTY回溯算法根據預定義規則進行原子分類;然后,根據半經驗HüCKEL方法計算分子中每種原子類型的原子描述符(前線軌道電子密度、電子超離域度、原子Π-電荷)建立描述分子的親電性質的特征矢量MEV;最后,使用擴展的支持向量機方法(SVM)對分子的基因毒性數據和及其特征MEV進行統計學習,得到該分子基因毒性的后驗概率估計。
聲明:
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我是此專利(論文)的發明人(作者)